Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms