Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms