Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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