Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUL1Q15846 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms