Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITSN1Q15811 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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