Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNHIT3Q15649 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms