Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ARHGEF6Q15052 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARHGEF6Q15052 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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