Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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