Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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SMCO1Q147U7 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SMCO1Q147U7 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SMCO1Q147U7 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SMCO1Q147U7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SMCO1Q147U7 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SMCO1Q147U7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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