Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAPQ14761 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282.1 ms