Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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