Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms