Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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