Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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