Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms