Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC097493.2-201ENST00000468675 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC104794.2-201ENST00000567540 1572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDAP1Q13442 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms