Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms