Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SRSF6Q13247 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SRSF6Q13247 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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