Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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