Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFX1Q12986 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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