Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN2AQ12879 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2AQ12879 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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