Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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