Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms