Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms