Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms