Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms