Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms