Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms