Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms