Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms