Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms