Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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