Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC3P51654 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC3P51654 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC3P51654 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms