Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATMP50440 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATMP50440 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATMP50440 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms