Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNTBP49356 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FNTBP49356 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
FNTBP49356 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FNTBP49356 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FNTBP49356 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FNTBP49356 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FNTBP49356 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FNTBP49356 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FNTBP49356 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNTBP49356 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNTBP49356 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms