Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms