Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms