Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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