Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMPOP42166 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMPOP42166 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMPOP42166 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMPOP42166 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms