Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MDH1P40925 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MDH1P40925 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms