Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBRP36941 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBRP36941 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBRP36941 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBRP36941 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms