Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CASQ1P31415 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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