Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms