Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms