Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms