Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms