Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GCSHP23434 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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