Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP4AP20648 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms