Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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