Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREB1P16220 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CREB1P16220 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CREB1P16220 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms